MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Salmonella enterica subsp. enterica serovar Weltevreden str. 2007-60-3289-1

Total Repeats: 48

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NT_187092	AGC	2	6	150	155	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	409249668
2	NT_187092	CTGG	2	8	208	215	0 %	25 %	50 %	25 %	409249668
3	NT_187092	A	7	7	250	256	100 %	0 %	0 %	0 %	409249668
4	NT_187092	GTT	2	6	430	435	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249668
5	NT_187092	CTG	2	6	457	462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249668
6	NT_187092	GCG	2	6	506	511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249668
7	NT_187092	AGA	2	6	525	530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249668
8	NT_187092	CTGG	2	8	568	575	0 %	25 %	50 %	25 %	409249668
9	NT_187092	GC	3	6	700	705	0 %	0 %	50 %	50 %	409249668
10	NT_187092	TGG	2	6	936	941	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249669
11	NT_187092	CGGT	2	8	969	976	0 %	25 %	50 %	25 %	409249669
12	NT_187092	CAC	2	6	1005	1010	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	409249669
13	NT_187092	CGG	2	6	1027	1032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	409249669
14	NT_187092	AAACA	2	10	1040	1049	80 %	0 %	0 %	20 %	409249669
15	NT_187092	TTA	2	6	1127	1132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249670
16	NT_187092	AAC	2	6	1195	1200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	409249670
17	NT_187092	T	7	7	1227	1233	0 %	100 %	0 %	0 %	409249670
18	NT_187092	A	7	7	1241	1247	100 %	0 %	0 %	0 %	409249670
19	NT_187092	CGCCA	2	10	1342	1351	20 %	0 %	20 %	60 %	409249670
20	NT_187092	GGA	2	6	1395	1400	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	409249670
21	NT_187092	TCAG	2	8	1409	1416	25 %	25 %	25 %	25 %	409249670
22	NT_187092	TGCT	2	8	1604	1611	0 %	50 %	25 %	25 %	409249670
23	NT_187092	GTG	2	6	1626	1631	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249670
24	NT_187092	AAG	2	6	2143	2148	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	409249671
25	NT_187092	TAC	2	6	2190	2195	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249671
26	NT_187092	TAT	2	6	2234	2239	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249671
27	NT_187092	TGG	2	6	2569	2574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	409249672
28	NT_187092	TG	3	6	2578	2583	0 %	50 %	50 %	0 %	409249672
29	NT_187092	TCT	2	6	2642	2647	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	409249672
30	NT_187092	TAC	2	6	2674	2679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
31	NT_187092	CAT	2	6	2721	2726	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
32	NT_187092	ATC	2	6	2752	2757	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
33	NT_187092	ATC	2	6	2764	2769	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
34	NT_187092	TCA	2	6	2816	2821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
35	NT_187092	GTA	2	6	2828	2833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249672
36	NT_187092	GTT	2	6	2865	2870	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	409249672
37	NT_187092	CAT	2	6	2874	2879	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
38	NT_187092	TCA	2	6	2904	2909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
39	NT_187092	TCA	2	6	2975	2980	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
40	NT_187092	ATC	3	9	2986	2994	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
41	NT_187092	TCC	2	6	3016	3021	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	409249672
42	NT_187092	ATC	2	6	3073	3078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
43	NT_187092	CAT	2	6	3090	3095	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
44	NT_187092	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	409249672
45	NT_187092	CAT	2	6	3187	3192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	409249672
46	NT_187092	ATT	2	6	3193	3198	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	409249672
47	NT_187092	CTG	2	6	3219	3224	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	409249672
48	NT_187092	ATG	2	6	3227	3232	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	409249672

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.